L'innovation technologique dans l'enseignement supérieur en Côte d'Ivoire est un sujet d'une importance capitale à l’ère où les progrès technologiques redéfinissent la manière dont la recherche doit être menée et appliquée. L'innovation comme idée, pratique ou objet, est considérée comme le facteur clé de la dynamique des sociétés contemporaines (Patrick-Yves BADILLO, 2013). Cet article se concentre sur l'émergence des Etablissements Publics Administratifs à caractère Scientifique et Technologique (EPAST) à la lumière de la nouvelle législation. Ces établissements qui sont sensés jouir d’une autonomie sont soumis à un contrôle strict de l’autorité publique, susceptible de limiter leurs performances. Au-delà de la conformité au cadre théorique, seule l’implication effective de tous les acteurs à travers la redéfinition des objectifs de la recherche et l’initiation de partenariats, est de nature à relever les défis et définir les opportunités qui s’offrent à l’enseignement supérieur.